学历:
厦门大学理学学士,电子信息科学与技术专业,2005;
厦门大学理学博士,无线电物理专业,2011。
研究方向:
网络建模新方法及其在生物医学领域的应用研究,空间代谢组学分析
主讲课程:
研究生课程《文献检索及科技英文论文写作》
学术兼职:
福建省等离子体与磁共振研究重点实验室 行政秘书
成果奖励:
《基于代谢组学的解毒化浊祛瘀法干预肝豆状核变性肝纤维化机制研究》安徽省中医药科学技术奖三等奖
课题项目:
1、国家自然科学基金,地区科学基金项目,个体化分子网络建模新方法应用于结直肠癌代谢异质性研究,2024-01至2027-12,合作主持;
2、福建省自然科学基金,面上项目,基于代谢表型的网络分析新方法及其在腧穴配伍效应评价中的应用,2020-05至2023-05,主持;
3、国家自然科学基金,青年项目,基于网络分析的代谢组学新方法及在结直肠癌研究中的应用,2019-01至2021-12,合作主持;
4、福建省自然科学基金,青年项目,基于核磁共振代谢组学技术研究艾灸胃经穴治疗慢性萎缩性胃炎癌前病变的作用机制,2015-04至2018-04,主持;
5、国家自然科学基金,面上项目,基于核磁共振代谢组学技术研究电针胃经穴对胃黏膜损伤修复的脑胃响应机制,2015-01至2018-12,合作主持;
代表作:
(1) Guo L, Xie PS, Shen XH, Lam TKY, Deng LL, Xie CY, Xu XN, Wong CKC, Xu JJ, Fang JC, Wang XX, Xiong Z, Luo SY, Wang JN, Dong JY*, Cai ZW*. Unraveling Spatial Heterogeneity in Mass Spectrometry Imaging Data with GraphMSI. Advance Science, 2025, 12(8), 2410840
(2) Shah MDS, Guo L, Xu XN, Deng LL, Lu KY, Dong JY, Zhao C*, Xu JJ*. eLIMS: Ensemble Learning-Based Spatial Segmentation of Mass Spectrometry Imaging to Explore Metabolic Heterogeneity. Journal of Proteome Research, 2024, 23(8): 3088-3095.
(3) Guo L, Liu XX, Zhao C, Hu ZX, Xu XN, Cheng KK, Zhou P, Xiao Y, Shah MDS, Xu JJ*, Dong JY*, Cai ZW. iSegMSI: An interactive strategy to improve spatial segmentation of mass spectrometry imaging data. Analytical Chemistry, 2022, 94(42):14522-14529.
(4) Xu JJ, Wang YS, Xu XN, Cheng KK, Raftery D, Dong JY*. NMF-based approach for missing values imputation of mass spectrometry metabolomics data, Molecules, 2021, 26(19): 5787.
(5) Liu WP, Xu JJ, Dai T, Shen GP, Feng JH*. An integrating strategy for serum metabolomics and microarray analysis to expand the understanding of diet-induced obesity, Analytical Methods, 2021, 13(28): 3127-3135.
(6) 发明专利:用于预测蛋白质翻译后修饰位点的深度学习方法。授权日期:2024年5月31日
(7) 发明专利:一种基于非负矩阵分解的质谱数据缺失值填补方法及系统。授权日期:2022年8月12日